El gobierno de la ETSIAMN corresponde a la Junta del Centro y a un Director que está asistido en sus funciones por el Subdirector-Jefe de Estudios. Los órganos de gobierno colegiados de la Escuela ETSIAMN son: la Junta de Centro y la Comisión Permanente de la ETSIAMN. Todos los miembros del equipo directivo, encabezados por el Director de la Escuela, constituyen los órganos de gobierno unipersonales.