No se puede saber. Básicamente depende de la carga de trabajo que tenga VirusTotal.
El análisis que hacen los motores anti-malware de VirusTotal es distinto al análisis que realiza un AntiVirus de escritorio.
La protección básica la ofrecen los AntiVirus tradicionales, mientras que este servicio permite obtener información adicional en el análisis de un fichero.
VirusTotal utiliza distintos motores anti-malware y este servicio genera la cuenta de motores que consideran limpio/infectado el fichero.
La política más conservadora consistiría en rechazar el fichero si hay algún motor que lo considere infectado.
Todo fichero analizado es compartido con los fabricantes de antivirus empleados en el análisis. Además, VirusTotal almacena, prácticamente, todos los ficheros que se analizan (sobre todo los infectados).
Así pues, sólo debe utilizarse este servicio cuando los ficheros a analizar tengan un acceso público.