Consell de Govern
És l'òrgan de govern de la Universitat i es reuneix almenys una vegada cada tres mesos. Entre altres funcions, estableix les línies estratègiques i programàtiques de la Universitat -així com les directrius i procediments per a l'aplicació d'aquestes- en els àmbits d'organització de l'ensenyament, la investigació, els recursos humans i econòmics i l'elaboració dels pressupostos.
Claustre Universitari
És el màxim òrgan de representació de la comunitat universitària. Està integrat pel rector, el secretari, el gerent i tres-cents membres de la comunitat universitària (entre ells directors de centre, professors, alumnes, personal d'administració i serveis, ajudants i personal d'investigació...). Li correspon l'elaboració dels Estatuts i les altres funcions que li atribueix la LOU.
Junta Consultiva
És l'òrgan ordinari d'assessorament del rector i del Consell de Govern en matèria acadèmica. Està composta pel rector, el secretari general i quaranta membres designats pel consell de Govern amb importants mèrits docents i investigadors acreditats. Està facultada per a emetre informes i formular les propostes que considere oportunes en matèries en què té competència.