Así como la cámara y el espectrómetro integrado en miniatura (MICAS), permite la realización de diferentes medidas en un paquete de bajo peso, PEPE contiene múltiples instrumentos en un paquete compacto de 6 Kg (construido por Southwest Research Institute y el Laboratorio Nacional de Los Alamos ). Además, se incluye un microcalorímetro de bajo peso, con un consumo mínimo de potencia, que ha desarrollado la Universidad de Stanford, para ayudar a comprender las interacciones plasma-superficie.
PEPE mide el espectro de energía de electrones e iones desde 3 eV hasta 30 KeV por unidad de carga y una resolución del 5%. En vez de usar partes móviles, barre de manera electrostática su campo de visión, consiguiendo una resolución de 45º en azimut y 5º en elevación. También mide la masa iónica en un rango de 1 a 135 amu por unidad de carga con una resolución de carga. PEPE realiza tres funciones en la Deep Space 1:
Validar el diseño de un conjunto de instrumentos físicos de plasma en un paquete.
Participar en la determinación de los efectos del sistema de propulsión iónica en la superficie de la nave e instrumentos y en el espacio ambiental, incluyendo interacciones con el 'viento solar'.
También hará medidas científicas interesantes durante el viaje y el encuentro con el asteroide y posiblemente los dos cometas.
De hecho, una clave en la investigación de la Deep Space 1, será si las medidas físicas en el espacio pueden ser llevadas a cabo desde la nave funcionando con el sistema de propulsión iónica para asegurar usos futuros y que no existan incompatibilidades.
